1990年，连南瑶族自治县共有卫生事业机构28个，医院（全乡镇卫生院，不含卫生站）14个，门诊所10个，卫生防疫站1个，妇幼保健站1个，药品检验室1个，各类卫生技术人员共366人。全县83个管理区中有73个建立医疗卫生站。卫生防疫工作有比较大的发展，基本控制了白喉、丝虫病、地甲病等地方病的发生。“四苗”预防的相应传染病发病率为零，接种合格率为92.9%。新生儿造册率为99.5%，人均寿命由新中国成立初期的35岁增至1990年的60多岁，延寿20多岁。1962年全县总人口中死亡率达8.97%，1972年下降为7.67%，到1990下降至6.38%。医疗卫生事业的发展，使因病死亡的人数大大减少。