元明清时期，瑶族丧葬多为岩葬、火葬、土葬。受宋代风俗影响，元代，被称为五溪蛮的瑶族仍行岩葬。元人周致中《异域志》卷下载：五溪蛮“遇父母死，行鼓踏歌，饮宴一月，尽产为椁，于临江高山凿龛以葬。三年不食盐”。明代对瑶族丧葬的记载不多。据明人王仕性《桂海志续》载，明代瑶族葬俗多较简单，“葬不用浮屠，宰牲饮酒而已”。

大部分地区的瑶族都有“买水浴尸”之俗。广西大瑶山一带的茶山瑶，由孝子、孝孙哭泣走到河边，向河神烧香焚纸，并投4枚铜钱下河，再用竹筒汲水3次，携回家烧热，由亲人替死者沐浴。广西富川一带，去“买水”的孝子必须穿白布孝衣，然后在水中加香粉或茶叶烧至温热。广东连南瑶族，“买水”的孝子、孝女须披头散发，到溪边烧香，投一枚铜钱入溪里，然后装水挑回。广西百色一带，用柚树叶和稻秆灰煮水为死者浴尸。广西巴马一带，用山姜叶、橙树叶煮水为死者浴尸。广西龙胜盘瑶，为死者浴尸时，要先用一小块新布蘸温水，在死者的腹部、背脊、手等处各抹几下，剃3刀头发，才换寿衣，穿寿鞋，中年以上死，则用棉纸做寿衣。

瑶族地区，家有老人病危，儿女、媳妇全聚齐身旁，恭听老人的临终嘱托。有的瑶族还要请舅舅及村老一起来听，以免日后发生纠纷。广西河池一带，老人临终时，由其儿女、媳妇、女婿扶其坐于床上，男性由子或婿扶，女性由女或媳扶，不让老人躺着去见祖先。广西扶绥瑶族，将一碗饭，一双筷置于老人床前，意为让老人临终前吃个饱。广西荔浦、富川等地，老人病危，将其床移至厅堂两侧，男左女右，并换上寿衣。临终前，亲人要将一枚银亳放入老人口中，俗称“含口钱”，意为不让其空口而亡。广西百色、巴马等地则在死者口中放硬币，意为让死者带去阴间用。广西大瑶山一带的花蓝瑶，则将银币一分为二，一半放死者口中，另一半由家人收藏，否则死者到阴间会贫穷，然后回来骚扰家人。

清代，各地瑶族丧葬已逐渐以土葬为主。瑶族土葬大多是垒坟安葬。湖南邵阳瑶族，“丧葬无衣衾棺椁之殓（近亦有用之者），无哀麻经带之服，无拜扫祭奠之礼。”溆浦县瑶族，“自古无庆吊，人死仍以棺检，不用鼓乐，不穿凶服，祭以酒肉。肉不用盐，徭巫谓之招亡。焚楮既葬，坟树忌剪伐，不祭扫。国朝以来，间有行之者，祭不登墓，必远距里许，或隔溪、山以祭，畏鬼故也。”广东连山排瑶，“死则服三年丧。亲始死，先相地掘坎，市棺置坎侧，以尸僵坐秤之，有倚者绳缚之。邻里为之舁，子妇服丧服，披麻辟踊哭泣，哀而送之。至坎，延徭道面尸诵章咒乃殓，殓毕而窆，封毕而归。其服也，无斩、齐、功、缌之分，竹桐杖屦之制也。朝死面昼葬，不俟二日三日也。服三年丧者，嫁娶宴乐不禁也，练、期、祥、禅也不知。既葬而卒哭，免丧而除服，如是焉而已。”连山八排瑶，“凡丧，亲族送猪钱一束焚之，白布一幅盖骸，修斋一夜，次早抬尸至山，方用棺木，择日而葬。丧家穿白衣。凡遇丧，亲族用楮钱一束，酒一埕为祭，婿用草纸三百张，米一斗，酒一坛”。

瑶族也有为死者戴孝的习俗。儿子、嫡孙和与妻同姓的女婿都身穿孝服，戴孝头巾或白帽；一般女婿只戴白头巾，而女儿、孙女则戴白或黑色头巾。白色丧物120天之后，黑色丧物40天之后才能洗涤，配偶戴孝120天之后才能再结婚。青衣瑶和蓝靛瑶在举行葬礼和行斋埋葬时间里，子孙后代忌吃油，不杀生，夫妻也不来往等等。埋葬40天之后，子孙后代才能理发或佩带各种银制的装饰品。

广西南丹和贵州荔波等地瑶族还有公共墓地，同一个姓氏的人，死后葬于同一个地方。葬后3日，有“送水”、“覆土”之俗。由死者亲属备办酒、肉、鸡等，到坟前祭死者，为新坟添土。

广西凌云，“诸瑶不重服丧。中资之户，惟男子稍披白巾，不设斋食，亲谊或以鸡、豕、米、香、帛之属助丧事，延觋诵咒超度，宰猪、羊款待来宾。其择葬惟凭法咒，有以鸡子一枚，先告灵前，携往幽僻深山，随处抛掷，应手而破，即为佳城。若亡者不乐其处，虽触石弗碎，则更觅他所以定葬穴，诸多迷信。葬后次日，亦延众科新坟。砍柴为生之瑶，祖若失邱垄所在，终其身，不向此山樵采。”广东连县、连山、阳山一带，“傜人死后，家人先洗尸身，修剃头发，然后衣以死者生平爱好之衣服（多至三数袭未定），陈尸床上，始招巫人，巫至，将尸移坐绘以太阳形之木质红漆‘老人’上，念经超度（如死者达三十六岁得鸣大炮致哀），各亲友亦来祭奠酌酒，择日出殡（或二三日不等）。出殡时，由子婿二人扛尸至坟前，将尸放入预置于坟房之木棺中，送丧亲友即出书有自己姓名之白布一方（约一尺见方），齐纳棺内，名为‘陪葬’。丧家各还白布一方，表示感谢，遂即盖棺掩土。葬后三日内，持火携饭往祭死者，亲属皆衣白作孝，多至七日，少则三日，但居丧为三年，至女婿送丧，必携酒一筒，饭一碗，猪肉一方（约半斤）以作奉祀。复备雨伞一柄遮掩尸身，如富有者，亦恒有用白布围绕。送丧各人行至坟场，与广州市民以白纱笼罩者或同出一义也。”广西大瑶山花蓝瑶，“媳妇或姑爷，临死时一定要有自己家里的人在场；不然亲家可以来捣乱。”人死断气，“在地上铺一条席子，把死尸放在席子上。若是人在晚上死的，则要等到次日朝上鸡啼时才放到席子上去。死者若是由婚姻关系而加入这家庭的，媳妇或姑爷，自己家里要送四百斤酒，二百斤猪肉，两只鸡和一块黑布。本族的人和亲戚，每家都要送一块白布，长度和人体相当。白布和黑布都裹在死人的身上。亲戚朋友都来吊孝哀哭。主人要替死者的小辈或同辈中年龄较死者为幼的男女，每人做一件白布的丧服，丧服是没有袖子的。男的头上缠一块白布；女的把头发披下来，用白纸围着，耳环上也挂着白纸。长辈或同辈中较死者年龄为长者都不穿孝。”次日下午便装尸入棺。“棺材放在门外，有一块白布从死人的床一直联到棺材里。棺材里有一个坛，米从白布上滚到这坛里去。这米是给死人‘吃’的。一切都预备妥当后，死尸由他的儿子、媳妇或女儿、姑爷连席抬到棺材里。撤去白布，把棺材盖闭上……把棺材抬到附近的山里去。家人和客人都跟着到山里。有名望的人若死了，送殡的人多至二三百人。他们带了刀、帽、伞等日用品放在棺材上给死人‘用’。”行土葬者，入土为安，以后每年清明前往祭祀。但亦有部分瑶族只在家中祭祀，不去坟前扫墓。