根据部署，百色地委、百色军分区及剿匪部队确定了剿匪重点和各个歼灭的方针，在原打击土匪的基础上，从4月15日开始大规模进剿，由五十三军统一指挥。以二一九师之六五五团、六五六团、六五七团，二一七师之六四四团，南宁军分区之四五五团，百色军分区之独立团并配合直接指挥直属县区武装进剿田林、西隆、东兰、凤山、凌乐、百色等地股匪；同时，二一九师配合云南、贵州省军区之十三个营的兵力会剿西林、西隆之匪。4月15日，解放军六五七团与西隆县大队攻打驻守克长的土匪张秉忠、杨登鹏等，接着直捣敌心脏“总统府边区司令部司令官兼师长”胡栋成驻地，歼敌300余人。股匪发觉解放军意图后，其主力千余人南窜云南广南县，北窜贵州。解放军随即开展搜剿，云南部队亦回云南追歼残匪。5月，匪“第七集团军参谋长”温武、“第十一纵队司令”黄东洋、“新三军军长”韦义英落网；匪“第七集团军总司令”吴中坚、“警卫师长何伟才”等在桂黔交界之地被封锁江河之贵州部队击毙。月底，百色地区股匪基本上被消灭了，歼匪15000余人。