意大利耶稣会教士利玛窦开创基督教在华传教第三个时期。明末有信徒近四万人。清康熙时教徒至十万余人。雍正以后，朝廷禁止传教。新教自一八〇七年由马礼逊传入我国。鸦片战争以后，西方国家取得内地传教权利，基督教有了迅猛的发展。由于该教的传布与外国侵略中国的行为相联系，不断引起中国人民的反抗，众多的“教案”就是明证。一九〇〇年的义和团运动，就是在反抗教会压迫的斗争中兴起的。至新中国成立前夕，我国有天主教徒三百万人，新教教徒一百万人。