1644年，清政府统一新疆后，十分注意吸收借鉴历代统治阶级对少数民族治理的经验教训，提高少数民族的社会地位，逐渐以民族“大一统”的观念取代了以往的“华夷之分”，提出各民族天下一家。在政治上对少数民族实行伯克制、扎萨克制。对其上层委以重任，尊重他们的威望，笼络优待各少数民族头领，并在一定程度上尊重他们的文化、宗教及风俗习惯。在经济上，减免赋税，减轻对少数民族的压迫和剥削，开展贸易活动。这些政策密切了民族关系，融合了民族感情，对于新疆的稳定、经济发展以及文化繁荣起到了积极作用。