元明清时期，随着瑶族地区封建化的加深，阶级压迫和民族压迫日益加剧，瑶族原始宗教继续向人为宗教转化。同时，随着社会矛盾的日益尖锐和汉、瑶族经济文化交流的加强，道教、佛教不断传人瑶区。受封建思想文化的影响，瑶族社会的封建意识逐渐加重，封建伦理道德观念逐渐确立，教育和科学技术也有发展。