花卉纹样是明清暗花织物纹样的主要题材。这里既有自然界存在的花卉，也有人们虚构出来的花卉。前者主要包括莲花、牡丹、菊花、梅花、芙蓉、海棠、桃花等，后者主要为宝相花、瑞花、大洋花等。这些花卉纹样既单独作为主题纹样，也相互组合共同构成装饰题材。此外，花卉纹样还作为其他纹样的辅助纹样出现。